CoBrain-Аналитика

Продукт

Статья посвящена «CoBrain-Аналитике» – проекту НТИ, исполнителем которого является Сколковский институт науки и технологий (Сколтех). Проект предусматривает создание платформы для сбора, хранения, обработки и анализа биомедицинских данных различных типов и форматов, а также разработки и использования приложений поддержки принятия врачебных решений с использованием моделей и алгоритмов искусственного интеллекта.

Разработчики: Сколтех (Сколковский институт науки и технологий, Skoltech)
Дата премьеры системы: 2016
Дата последнего релиза: 2020/02/26
Отрасли: Фармацевтика, медицина, здравоохранение
НТИ, исполнителем которого является Сколтех (Сколковский институт науки и технологий, Skoltech)

Содержание

Структура системы

Платформа «CoBrain-Аналитика» состоит из трех продуктов: CoLab, 2nd opinion и MedEducation.

Первый, CoLab, представляет собой единое рабочее пространство, объединяющее людей различных компетенций для работы с данными и алгоритмами с целью решения какой-либо научной или коммерческой проблемы. Данные в CoLab можно загружать напрямую. Они надежно защищены и хранятся в России. При этом вся информация, содержащаяся в биомедицинских данных CoLab деперсонализирована. Даже более того – при необходимости ее можно в нем деперсонализировать при помощи соответствующих алгоритмов и инструментов. Главная опция CoLab – создание приложений помощи принятия врачебных решений. Помимо того, на основе его информации врач, в частности, может писать аннотации. Также продукт позволяет сделать необходимую для той или иной гипотезы выборку.

Второй продукт системы «CoBrain-Аналитика» – 2nd opinion. Он представляет собой площадку с готовыми приложениями помощи принятия врачебных решений. На ней представлены приложения как для широкого потребителя, так и для врачебного сообщества. Пользователь может загрузить в них свои данные и получить альтернативное мнение, основанное на результате работы программы с использованием алгоритмов искусственного интеллекта, а не врачей. Для этого ему совершенно необязательно обладать специальными знаниями, выполнять определенные требования и совершать выгрузку алгоритмов. Однако врач не имеет права ставить диагноз на основании подсказок приложений, размещенных на 2nd opinion.

По состоянию на 25 мая 2020 года 2nd opinion еще находится на стадии доработки. Решаются последние технические задачи и разрабатывается необходимая документация. В открытом доступе 2nd opinion появится в первой половине 2021 года.

Третий продукт, MedEducation, представляет собой образовательную часть платформы. Она включает в себя открытый лекторий, на котором любой желающий может прослушать лекции об использовании современных технологий в медицине, и раздел со специализированными курсами для медицинских работников, позволяющими освоить базовые навыки программирования, работать с большими данными и алгоритмами искусственного интеллекта. Вероятно, в будущем эти курсы смогут быть интегрированы в программу непрерывного медицинскогообразования, аккредитованную Минздравом. Помимо того, MedEducation уже скоро позволит проводить онлайн-конференции и консилиумы.

Финансирование проекта

Общий объем инвестиций проекта составляет 487 млн рублей. По состоянию на 25 мая 2020 года эти средства еще не полностью израсходованы. Потребностей в дополнительном финансировании у проекта пока нет.

История

2020: Туманные перспективы

Спустя четыре года после начала разработки платформы «CoBrain-Аналитика», для которой предусмотрен объем инвестиций в 487 млн рублей, ее перспективы остаются неясными. Платформа предназначена для сферы здравоохранения: исследовательских лабораторий и медицинских клиник. По состоянию на 2020 год основная часть разработки завершена, платформа доступна потенциальным клиентам для тестирования на бесплатной основе, а в дальнейшем ее планируется монетизировать. Однако пока непохоже, что она сильно интересна потенциальным заказчикам.

Руководитель проекта Игал Зак, к которому обратился TAdviser, сказал, что в марте-апреле интерес медицинских клиник к платформе возрос, но не предоставил TAdviser никакой конкретной информации по поводу того, сколько организаций проявили к ней интерес.

Он только привел данные, что в 2016-2019 гг. в Сколковский институт науки и технологий поступило около 600 запросов от «юридических и физических лиц» по вопросам, связанным с системой. Больше всего пользователей интересовало то, с какими данными может работать платформа, её алгоритмы, а также совместные исследования, говорит Игал Зак.

«
Замечу, что запросом мы можем считать, согласно требованиям заказчика, только то обращение к платформе, которое осуществляет юридические лицо, с которым у нас заключено соответствующее соглашение. Таким организациям к системе предоставляется доступ. Правда, пока только ограниченный, - отметил Игал Зак.
»

После завершения создания «CoBrain-Аналитики», по его словам, все действия вокруг платформы будут связаны с ее коммерциализацией.

«
Главная задача в связи с этим будет в поиске соответствующего стратегического партнера. Командой проекта он уже инициирован, - заявил TAdviser Игал Зак.
»

Выделенные на создание платформы «CoBrain-Аналитика» 487 млн рублей, по его словам, пока еще не полностью израсходованы. Однако сколько именно уже потрачено на создание системы Игал Зак TAdviser не уточнил.

TAdviser опросил ряд медицинских клиник относительно их интереса к платформе «CoBrain-Аналитика». Как выяснилось, кого-то она отпугивает сложностями внедрения и использования, отсутствием достаточного количества примеров успешного применения и некоторыми другими факторами.

«
Первый фактор связан с тем, что, как правило, все алгоритмы искусственного интеллекта, подобные тем, что используются в «CoBrain-Аналитика», строятся на довольно «грязных» данных - то есть низкого качества. Как следствие, возникает вопрос: на каких данных построены уже существующие приложения «CoBrain-Аналитика» и на каких могут быть построены новые? Другой момент – как в большинстве случаев данные решения будут интегрироваться в инфраструктуру медицинских клиник? Большая часть из них не имеет информационных систем с необходимой для этого функцией, - объясняет TAdviser исполнительный директор BestDoctor Михаил Беляндинов.
»

При этом он отметил, что клиники более заинтересованы в продуктах, помогающих анализировать, насколько правильно было принято врачом то или иное решение, нежели в разработках, помогающих его принять.

«
В хороших клиниках внутренняя экспертиза оценивает то, насколько правильно проходит лечение пациентов, на основе данных медицинских карт ряда больных. Решения, помогающие это сделать, уже существуют на рынке, и некоторые клиники их уже используют, - отметил в разговоре с TAdviser Михаил Беляндинов.
»

Вместе с тем, считает он, частные клиники в России в целом еще технически не очень готовы к использованию прогрессивных ИТ-разработок. Самые современные информационные системы используют только некоторые государственные клиники.

По словам основателя и управляющего партнера группы компаний GMS, специализирующейся на разнообразных медицинских услугах, Игоря Краснолуцкого, говорить о реальном интересе со стороны как частных, так и государственных медицинских клиник к платформе пока очень рано в силу того, что их менеджерам, людям весьма приземленным, практичным и рационально мыслящим, необходима демонстрация реальной выгоды того или иного продукта.

«
А это возможно, когда уже есть реальный практический опыт использования продукта, - пояснил TAdviser Игорь Краснолуцкий.
»

Директор по внешним коммуникациям и международным отношениям московского Международного медицинского кластера «Сколково» Фаина Филина считает, что проекту «CoBrain-Аналитика» следует тщательно проработать свой имидж и разработать простые, понятные, доходчивые коммуникации.

«
В сети и даже на сайте не так легко найти информацию, просто и доступно объясняющую суть проекта и существующие направления развития, а в некоторых материалах в СМИ эффективность и целесообразность создания проекта в принципе ставится под сомнение, - заметила Фаина Филина.
»

В медклинике «Медси» TAdviser заявили, что активно развивают собственное аналитическое направление и открыты к сотрудничеству со стартапами, которые предлагают интересные решения в области анализа медицинских данных. При этом в клинике отметили, что затруднения у медицинских организаций может вызвать использование не только такого продукта платформы «CoBrain-Аналитика», как 2nd opinion - площадки с готовыми приложениями помощи принятия врачебных решений, но и CoLab - рабочего пространства платформы для создания таких инструментов.

«
При внедрении новых технических решений из маркетплейса «CoBrain-Аналитика» 2nd opinion могут возникнуть самые разные сложности. Среди них – вопрос обучения медицинского персонала работе с платформой, обеспечение безопасности медицинских данных и вопросы интеграции в принятые в клинике медицинские информационные системы. При участии в разработке новых решений в CoLab возникает вопрос о защите интеллектуальной собственности, а также о возможности при необходимости вывести свои разработки из контура платформы, - полагают в «Медси».
»

В организации добавили, что, по их мнению, платформа «CoBrain-Аналитика» будет пользоваться спросом только тогда, когда цена ее использования будет приемлемой.

Относительно возможной стоимости использования платформы пока никакой ясности нет. По словам Игала Зака, одним из перспективных вариантов монетизации проекта является оплата пользователем определенного числа запусков приложений платформы. Второй вариант – подписка на платную часть функционала системы.

«
Размер оплаты в первом и втором случаях для клиник и компаний пока озвучить не можем, для рядового гражданина он будет сопоставим со стоимостью решений зарубежных аналогов. Отмечу, что пока использование сервисов проекта для партнеров бесплатно, - сказал TAdviser Игал Зак.
»

Основными партнерами «CoBrain-Аналитики», по его словам, выступают медицинские организации из Москвы и Санкт-Петербурга. Они предоставляют данные для одного из продуктов системы - Collap. Изначально ряд партнеров предоставлял проекту данные на коммерческой основе, но теперь все организации предоставляют ему информацию безвозмездно.

В частности с проектом сотрудничает центр нейрохирургии имени академика Н. Н. Бурденко. Учреждение использует несколько приложений Collap. К примеру, у него проходит клиническое испытание приложение, делающее на основе снимков МРТ локализацию функциональных зон мозга.

Также партнерами проекта выступают центр им. Вишневского, центр им. Кулакова, центр им. Соловьева и центр им. Рыжих. Для последнего будет разработано приложение, служащее помощником в определении раковых изменений в лимфоузлах и других органах малого таза. Для центра им. Кулакова и центра им. Соловьева уже заканчивается разработка приложений, помогающих в диагностике психических заболеваний, в частности депрессии, шизофрении и эпилепсии.

Кроме медицинских организаций партнерами проекта выступают разнообразные бизнес-структуры. Это, в частности, производители оборудования и разработчики алгоритмов на основе искусственного интеллекта. Например, такие крупные компании, как «Третье мнение», «Энигма», Brainlab. Для них участие в проекте важно с точки зрения обмена данными и возможности позиционирования на площадке 2nd opinion.

Также с проектом сотрудничают совсем молодые компании – только-только вступающие в «Нейронет», стартапы и те, кто еще только регистрируют юридическое лицо. Для них проект может быть полезен, в частности, как возможность хранения данных, использования вычислительных мощностей и проведения совместных экспериментов.

2019

План запуска системы учета биологических материалов человека при помощи ИИ

Искусственный интеллект (ИИ) будет диагностировать заболевания на основе медицинских анализов россиян - такой проект планируется запустить в 2021 году, сообщили в пресс-службе проекта «CoBrain-Аналитика» РИА Новости 4 ноября 2019 года.

План запуска системы учета биологических материалов человека при помощи ИИ. Фото: novoshishminsk.ru
«
Специальная система учета биологических материалов человека при помощи искусственного интеллекта будет запущена в 2021 году. Она будет представлять собой сервис на базе ИИ для улучшения диагностики социально значимых заболеваний, что позволит оптимизировать их терапию, а также сделать её более персонифицированной. Пациент пройдет предварительные тесты и сдаст биоматериал, а затем получит персональное лечение. Возможности искусственного интеллекта будут использованы и для разработки препаратов, - рассказал собеседник агентства[1].
»

Представители «CoBrain-Аналитики» отметили, что искусственный интеллект будет изучать, в частности, образцы тканей, крови и мочи, полученные от пациентов с различными серьёзными заболеваниями, такими как наследственные онкологические синдромы, рак лёгкого, рак поджелудочной железы, а также тяжёлые нейродегенеративные заболевания. Эти данные будут сопоставляться с клиническими данными из различных медицинских учреждений и биобанков РФ. Затем пациенту будет предлагаться персональное лечение.

Для запуска системы специалисты «CoBrain-Аналитика» подписали соглашение с компанией «Национальный БиоСервис». Обе организации выполняют проекты в рамках дорожных карт HealthNet и NeuroNet Национальной технологической инициативы (НТИ) - госпрограммы поддержки перспективных направлений технологического бизнеса в России.

Решения для рентгенологов Care Mentor AI на витрине CoBrain

22 октября 2019 года Сколковский институт науки и технологий («Сколтех») сообщил о том, что, в соответствии с подписанным соглашением, на витрине платформы CoBrain представлены решения системы искусственного интеллекта для анализа и интерпретации результатов лучевых методов исследования Care Mentor AI, анализирующие рентгенографии органов грудной клетки, шейного отдела позвоночника, стопы и коленных суставов.

На платформе «CoBrain-Аналитика» появились решения для рентгенологов от Care Mentor AI

Партнер проекта «CoBrain-Аналитика» Care Mentor AI выпустил ряд продуктов на базе технологий искусственного интеллекта, которые анализируют лучевые диагностические изображения и определяют наличие на них признаков патологий, в том числе социально значимых заболеваний, обращая на это пристальное внимание врача. Решения компании уже запущены в ряде отечественных клиник.

«
Мы всегда были открытой командой и готовы делиться своими наработками с теми, кто так же, как и мы, работает над созданием прорывных технологий, которые скажутся на качестве нашей медицины, а, значит, и уровне жизни в нашей стране и в мире. Первые шаги обычно бывают самыми трудными, и все заинтересованы помогать друг другу, обмениваться техническими решениями и обезличенными данными, которые остаются ценным и дефицитным ресурсом, необходимым для обучения нейросетей. В этом смысле мы рады появлению такой платформы обмена информацией, как CoBrain, и рады оказаться полезными проекту, — заявил Олег Григорян, CEO Care Mentor AI.
»

По словам руководителя проекта «CoBrain-Аналитика» Игала Зака, одна из задач платформы – создание витрины, где будут размещены приложения поддержки принятий врачебных решений на основе искусственного интеллекта, созданные разработчиками «CoBrain-Аналитики» и партнерами проекта. Витрина станет единой точкой доступа к множеству различных приложений для медицинских работников и научных исследователей, что соответствует недавно принятой национальной стратегии развития искусственного интеллекта в России.

Единая платформа и система запросов для биобанков

Биобанк Сеченовского университета совместно со Сколковским институтом науки и технологий («Сколтехом») приступили к разработке единой платформы и системы запросов для биобанков в части предоставления информации об имеющихся образцах в рамках проекта «Co-Brain-Аналитика». Об этом сообщили в «Сколтехе» 14 октября 2019 года.

Уникальность биобанка заключается в наличии огромной клинической базы университета: свыше 65 тыс. пациентов, более 25 тыс. операций ежегодно. Также его делают уникальным мощности научно-технологического парка биомедицины.

В перспективе биобанк совместно с биобанками других научных и клинических организаций планирует создать единую информационную среду для ученых с целью получения ими доступа к коллекциям биологических образцов и проведения исследований на национальном и международном уровне.

«
Наша задача – стать универсальным сервисом для врачей и ученых, взяв на себя рутину сбора и хранения биологических образцов и связанной с ними информации, - отметил директор биобанка Института регенеративной медицины Сеченовского университета, вице-президент Национальной ассоциации биобанков и специалистов по биобанкированию (НАСБИО) Владимир Беляев.
»

В планах организаций – обеспечение взаимодействия пользователей платформы «Co-Brain-Аналитика» с биобанками в части предоставления информации об имеющихся образцах. Целью предоставления доступа к биомедицинским данным является создание решений в области систем поддержки принятия врачебных решений на базе алгоритмов машинного обучения.

Программа акселерации технологических проектов «AI & BIGDATA в медицине»

Сколковском институте науки и технологий («Сколтех») совместно с компанией Philips запускают программу акселерации технологических проектов «AI & BIGDATA в медицине». Об этом сообщили в «Сколтехе» 11 февраля 2019 года.

Цель программы – поиск и развитие проектов, способных создавать коммерческие продукты в ключевых сегментах рынка NeuroNet НТИ на основе собственных наработок, а также на основе результатов исследований центра нейробиологии и нейрореабилитации «Сколтеха» и данных и алгоритмов, размещенных на платформе «Co-Brain-Аналитика» по темам:

  • ранняя диагностика, лечение и предотвращение нейродегенеративных заболеваний;
  • системы ранней предиктивной диагностики и мониторинга;
  • разработка технических средств реабилитации с применением нейротехнологий;
  • прогнозирование массовых и индивидуальных поведенческих эффектов на основе нейро- и биометрических данных;
  • развитие нейроинтерфейсов и технологий VR и AR в обучении.

Акселерационные модули и хакатоны пройдут в период с февраля по май 2019 года в Москве, Томске и Новосибирске. Лучшие команды каждого региона будут защищать свои проекты перед экспертами на Startup Village в конце мая 2019 года в «Сколково».

Каждый модуль будет включать в себя четырехдневный интенсив с экспертами программы, а также месяц заочной работы под руководством опытных менторов.

Во время программы с участниками будут работать профессора центра нейробиологии и нейрореабилитации «Сколтеха», инновационной лаборатории Philips, центра компетенций беспроводной связи и интернета вещей НТИ, представители компаний-членов отраслевого союза NeuroNet, а также эксперты из ВУЗов и компаний-партнеров.

Победители хакатонов и программы акселерации разделят денежный приз от партнера программы – компании Philips, получат возможность стать резидентами «Сколково», пройти стажировку в лабораториях «Сколтеха», перейти в международные программы акселерации и продолжить свое развитие в рамках международного сообщества.

2018

Смена проектом заказчика

В декабре 2018 года году у проекта «CoBrain-Аналитика» сменился заказчик. Его роль вместо NeuroNet взял на себя фонд «Сколково». Об этом сообщил TAdviser руководитель проекта Игал Зак.

В результате смены заказчика платформа сменила свой фокус, став более заточенной на медицину, а не обработку нейроданных. Кроме того, ее потребителем стал более широкий круг пользователей. Ими стали не только ученые, но также медики и представители бизнеса – сотрудники молодых стартапов, начинающие Data Scientist, специалисты клиник, рядовые пользователи. При этом было принято решение о значительной доработке системы.

Смена заказчика проекта, по словам Игала Зака, была вызвана необходимостью расширения системы для ее применения в медицине - потребностью в компетенциях «Сколково».

«
После того, как фонд стал заказчиком платформы, все действия над ней приобрели характер работы над продуктом. Из нее стали делать нечто более масштабное, чем просто систему для создания алгоритмов - платформу из разного рода сервисов, позволяющих в дальнейшем ее автоматизировать и монетизировать, - рассказал TAdviser Игал Зак.
»

Доступ к датасетам

Платформа «CoBrain-Аналитика» открыла доступ к структурированным наборам данных – датасетам. Об этом сообщили в Сколковском институте науки и технологий («Сколтехе») 27 ноября 2018 года.

Для того, чтобы получить доступ к каталогу датасетов «CoBrain-Аналитики», пользователю необходимо зарегистрироваться на платформе app.cobrain и пройти короткую процедуру верификации. После этого он может начать работать не только с открытыми датасетами, но и другими доступными инструментами платформы.

По состоянию на 27 ноября 2018 года, на платформе размещены не только датасеты, полученные от партнеров «Сколтеха», но и размещенные другими пользователями. Например, датасет от компании «Биодиджитал», который содержит в себе ЭМГ-данные с классификацией жестов руки и описанием.

«
Мы разрабатываем человеко-машинный интерфейс, основанный на регистрации электромиографической активности и распознавании жестов рук. Интерфейс должен послужить основой для системы управления бионическим протезом – достаточно сложного решения, которое требует большого количества данных для обучения классификатора. Мы предполагаем, что наши датасеты будут полезны для других исследователей, а также помогут совместно решить эту амбициозную задачу, – сообщил представитель компании «Биодиджитал» Булат Айтбаев.
»

«
Компания Биодиджитал» стала первой компанией разместивший в открытом доступе свой датасет на платформе «CoBrain-Аналитика». Надеемся, что наша платформа поможет молодым компаниям и специалистам data science в достижении их целей, упрощая поиск и работу с данными, - отметила заместитель руководителя проекта «CoBrain-Аналитика» Сандра Бит-Варда.
»

«
Релиз функционала платформы происходит постепенно, так как для нас весьма ценна обратная связь от пользователей и мы нацелены выпустить качественный и востребованный продукт. Наша главная задача - создать полноценное рабочее онлайн-пространство и мастерскую для работы с данными и алгоритмами их обработки и анализа, где каждый из пользователей - будь то data scientist, врач или технологический стартап - смогут найти необходимые инструменты для работы с ценными данными, - рассказал руководитель проекта «CoBrain-Аналитика» Дмитрий Мацнев.
»

Помимо каталога датасетов, который в скором времени эволюционирует в полноценную версию маркетплейса, пользователям платформы также будут доступны следующие сервисы:

  • маркетплейс алгоритмов и приложений;
  • сбор данных по запросу;
  • организация совместной деятельности/создание совместных проектов;
  • высокопроизводительные вычисления;
  • хранение данных;
  • разметка данных.

Создание основного функционала

К ноябрю 2018 года Сколковский институт науки и технологий(«Сколтех») разработал основной функционал платформы «CoBrain-Аналитика» и ее основные элементы – ядро и подсистемы. Об этом сообщил TAdviser руководитель проекта Игал Зак.

«
К примеру, были разработаны системы запросов, хранения данных, их обработки, загрузки и выгрузки. Таким образом, платформа уже была рабочим инструментом. В нее можно было, в частности, загрузить алгоритм и дать ему данные для обработки. При этом система была тщательно протестирована партнерами и заказчиком проекта в процессе создания. Через соответствующие тесты она проходила каждые полгода, - рассказал TAdviser Игал Зак.
»

Изначально планировалось, что «CoBrain-Аналитика» до конца 2018 года будет представлена Правительству РФ и, в случае одобрения, осенью 2018 года будет предложена государственным и частным клиникам[2].

«Сколтех» и ФГБУ «НМИЦ ПМ» будут сотрудничать по проекту

Сколковский институт науки и технологий («Сколтех») совместно с ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр профилактической медицины» Минздрава России (ФГБУ «НМИЦ ТПМ») интегрируют «НМИЦ ТПМ» в систему сбора деперсонализированных данных в рамках медицинского проекта «CoBrain-Аналитика». Соответствующий двухсторонний меморандум партнеры подписали в марте 2018 года в Москве.

Подписи под документом поставили ректор АНО высшего образования «Сколковский институт науки и технологий» Александр Кулешов и директор ФГБУ «НМИЦ ТПМ» Оксана Драпкина.

ФГБУ «НМИЦ ТПМ» решает актуальные задачи сохранения и укрепления здоровья россиян, снижения заболеваемости и смертности от основных хронических неинфекционных заболеваний, активно участвует в крупных российских и международных исследованиях, посвященных изучению хронических неинфекционных заболеваний и вопросам их профилактики, взаимодействует с коллегами из регионов по этим вопросам. Кроме того, в центре развиваются такие направления, как персонализированная медицина и телемедицина.

Двухстороннее сотрудничество позволит быстро и эффективно нарастить базу медицинской информации проекта «CoBrain-Аналитика», а НМИЦ ТПМ получить доступ к современной системе централизованного хранилища медицинских данных, что позволит научным сотрудникам и врачам ФГБУ «НМИЦ ТПМ» в режиме реального времени обращаться к обширной базе клинической и параклинической информации и проводить ее анализ.

2016: Старт разработки системы «CoBrain-Аналитика»

В 2016 году в рамках НТИ Сколковский институт науки и технологий («Сколтех») приступил к реализации проекта «Разработка информационно-аналитической системы по обработке больших нейроданных для поддержки внедрения технологий НейроНет «CoBrain-Аналитика».

Цель проекта - создание биомедицинской платформы для сбора, хранения, анализа и обработки больших биомедицинских данных о головном мозге человека в различных состояниях и в различных модальностях.

Основное отличие проекта от других платформ, хранящих нейроданные, заключается в мультимодальном подходе и комбинировании различных типов данных по одному и тому же субъекту исследования (пациенту).

Система «CoBrain-Аналитика» создается не только для оказания помощи профессионалам из научных лабораторий и институтов, лечебно-профилактических учреждений и коммерческих организаций, но и для внедрения уникальных инструментов анализа данных в российское здравоохранение.

Смотрите также

Примечания



СМ. ТАКЖЕ (5)